第一，充分利用土壤中各种营养元素，提高肥料利用率。各种蔬菜有不同的需肥规律，实行轮作可使各种主要营养元素得到较充分的吸收利用，使土壤中各主要营养元素之间保持相对平衡。蔬菜作物中，有速生叶菜类，葱蒜类等浅根性作物，也有根菜类、茄果类、豆类、瓜类（黄瓜除外）等深根性作物，如果将它们相互轮作，就可使土壤浅层和较深层的营养元素都得到吸收利用，土壤肥力和肥料的吸收利用率明显提高。

第二，有利于改良土壤结构，提高土壤肥力。种植不同蔬菜作物，所留给土壤有机质数量不同，如豆类和深根性的瓜类蔬菜，可留给土壤较多的有机质。另外，不同蔬菜往往施用不同种类和数量的肥料，如种黄瓜、番茄、大白菜，常施入较多的有机肥和化肥，在轮作中安排这几种蔬菜，有利于增加土壤有机质，改良土壤结构，不断提高土壤肥力。

通过合理轮作，有利于控制和减少某些病害的发生，也是检查轮作是否得当的主要标志。例如，大蒜是须根系类型，土壤下层养分难以吸收，同时它的根系在生长过程中分泌一种大蒜素，对多种细菌、真菌等有较强的抑制作用。大蒜后茬栽培大白菜，地力肥沃，软腐病很少发生。因为将不同科、不同种的蔬菜相互轮作，可以使病原物失去寄主，或改变了病原物的生存条件，达到消灭和减少病原物，进而控制或减少病害发生。菜田，实行严格的轮作，有条件的实行粮菜轮作，水、旱轮作，是控制某些土壤传染病病害行之有效的措施。