土壤的化学指标如全盐含量、pH值、氮、磷、钾含量以及土壤酶活性是表征土壤肥力和土壤生态系统中物质与能量流动的重要参数。设施栽培由于得不到雨水淋洗,加之农民过量施用化肥,导致土壤盐分在表层大量积聚,次生盐渍化普遍发生。研究表明,施用生物有机肥可以有效降低土壤全盐含量,改善土壤次生盐渍化现象。将含有微生物菌种的生物有机肥施入连作障碍大棚土5周之后,土壤电导率值显著降低,同时土壤溶液中盐浓度明显下降,施用生物有机肥有效遏制了盐分向土壤表层积聚的势头。腐植酸生物肥用于保护地次生盐渍化土壤,同对照相比,土壤电导率值显著降低,阳离子、阴离子和全盐含量明显减少,土壤次生盐渍化问题得到了一定程度的改善。
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生产中化肥的长期过量施用会破坏土壤的缓冲能力和离子平衡能力,导致土壤酸化、pH值下降。土壤酸碱度不仅影响植物的生长发育,同时还会严重影响土壤养分的有效性。施用生物有机肥可以调节土壤pH值,改善土壤养分状况。但由于生物有机肥的组成成分和性质不同,对土壤pH值的影响也不同。试验表明稻草、秸秆类有机物料可以提高土壤pH值,改善土壤酸化现象;而猪粪类的有机物料能降低土壤pH值。研究发现,有机物残渣发酵制成的生物有机肥可以提高土壤对酸化的缓冲能力;研究结果也表明,增施生物有机肥能够提高土壤pH值,对改良偏酸性土壤具有重要意义。连续3年施用枯草芽孢杆菌生物有机肥后土壤pH值逐年下降,说明此种生物有机肥可以降低土壤酸性。目前市场上有一些专用改良土壤酸碱度的生物有机肥,其组成成分含有酸性或碱性物质,在实际生产中可以根据需要选择施用,以达到调节土壤pH值的目的。