施蚓粪等有机肥可以显著改变微生物的种群结构。细菌与真菌比可以反映土壤腐熟程度和肥力水平，细菌量越多可能土壤质量越高,表明施蚓粪和牛粪比施化肥能显著提高土壤质量。施蚓粪和牛粪处理的土壤呼吸显著增强，这是因为施牛粪和蚓粪提高了土壤有机质水平，从而促进土壤呼吸。表明施蚓粪和牛粪能提高土壤微生物活性，提升土壤质量。施有机物料可以显著提高土壤酶活性的结果一致。这是因为有机肥施用增加了土壤有机质，从而增加了土壤微生物的碳源，促进微生物的增殖，刺激酶活性提高。有机肥不仅可作为土壤酶的底物诱导酶活性，同时有机肥自身携带的微生物和酶也可增加土壤酶活性。

施蚓粪和牛粪比施化肥能显著改善高速公路工程建设损毁土地的土壤物理性状,提升土壤理化综合质量并促进作物生长,施有机肥,特别是施蚓粪是快速修复高速公路工程建设损毁。