有机肥料对于改良土壤结构、提高农产品产量和品质、实现农业增产增收都发挥着重要的作用，而且还能减少集约化农业生态系统中由于单一施用化肥导致肥料利用率下降的问题，是保护土壤肥力与农村环境，实现农业循环经济的需要。

但长期施用化肥导致土壤理化性质得不到改善，养分供应不平衡，从而胁迫菠萝的生长，限制其产量和品质提高，成为菠萝产业发展的重要瓶颈。一些长期定位试验也表明，红壤上施用氮磷钾肥有一定增产效果，但连年种植也会导致中微量元素亏缺，不能保持作物高产。

品质方面，增施有机肥处理的可溶性糖含量和可滴定酸含量高，增施有机肥处理的维生素C含量最高，增施有机肥提高糖酸比，说明增施有机肥可改善菠萝果实营养风味。同时增施有机肥在菠萝高产优质方面效果相对较优。