微生物菌肥对减少苹果花脸病发生，提高产量和果实品质的作用。施用微生物菌肥显著促进了花脸病苹果植株根系的生长，增强了根系对氮的吸收和向地上部的运输，从而提高了植株对氮肥的吸收利用，一定程度上减轻了花脸病对产量和品质的影响。

微生物肥料的应用不仅能促进果树树体生长发育，还能提高果品产量和质量，而更重要的是，微生物肥料所提供的有益菌能有效改善果树根际土壤环境，促进根系对各种矿质元素的吸收，对果树的健康和可持续生产起着关键作用。施用生物有机肥的果树，果实个头增大、产量增加。微生物肥料均提高了果实的含糖量，其中果实可溶性固形物含量和总糖含量有不同程度的提高。微生物肥料能调节土壤酸碱度，促进土壤养分的活化，使土壤微生物数量及活性增加，促进土壤物质的循环与利用，利于果树的生长与发育。