生物有机肥集生物肥和有机肥优点于一体，既有利于农产品增产增收，又可培肥土壤、改善土壤微生态系统、减少天机肥料用量，改善农产品品质。其作用主要有以下三个方面。

(一)提高作物产量，改善作物品质

    生物有机肥克服了化肥养分单一、供肥不平衡的缺点，注重生物、有机、无机相结合的养分互动互补作用，施用后既可提高作物产量，也可有效改善作物品质，提高农产品的安全性。生物有机肥营养物质释放缓慢，以氮素营养而言，进入植物细胞后无需消耗大量能量和植物光合作用产物，如糖分和有机酸等，直接参与植物细胞物质的合成，故植物生长快，积累的糖分等物质多，自然农产品质量好，且很少有硝酸盐等有害物质污染。

(二)提高土壤肥力，改善土壤理化性状

    土壤有机质含量是土壤肥力的物质基础，是衡量土壤肥力的一项重要指标。我国耕地土壤有机质含量偏低，平均仅为1．8％，与欧美等发达国家的地力水平差距较大。施用生物有机肥不仅能补充被消耗的有机肥料，而且还能不断提高土壤有机质含羞。如在烟草的种植中应用生物有机肥，就可使土壤纳有机质含量得到增加。此外，据研究，施用生物有机肥后，土壤容重较对照降低12．5％，毛管孔隙度增加9．8％，可以明显改善土壤结构，提高土壤保水保肥和通气能力。同时，速效磷、速效钾、全氮、全磷和有机质含量分别比对照高出47．8％、77．1％、5．7％、65．o％和75．8％。相关研究还证明，有机质经微生物分解后，可缩合成新的腐殖质，它能与土壤中的黏土及钙离子结合，形成有机一无机复合体。促进土壤中水稳性团粒结构的形成，从而可以协调土壤中水、肥、气、热的矛盾，改善土壤结构，使土壤硫松、耕性交好。

（三）改善 土壤生态环境，减少植物病虫害的发生

    生物有机肥具有改善土壤生态环境及改善土壤微生物区系的作用，在减少植物病虫害发生方面发挥着更为重要的作用。这是因为在生物有机肥中含有多种特效菌，在微生物的生长繁殖过程中，能分泌出多种抗生素及植物生长激素，不但能抵制植物病源微生物的活动，起到防止植物病害的作用，而且能刺激作物的生长，使其根系发达，促进叶绿素、蛋白质和核酸的合成，提高植物的抗逆性。