畜禽粪便中的有机污染物主要是因为饲料中的添加剂，由于养殖场添加相关物质往往是保密的，抗生素等有机物的投入数量目前尚无法估计。 

抗生素类促生长剂大多数在畜禽体内有残留现象，并且当残留量达到一定水平后就不会继续在植物内累积，且在停止饲喂含抗生素类饲料一段时间后，便可由动物机体本身代谢排出，通过粪便进入环境。我国的研究也已经证实有机肥中存在POPs（持久性有机污染物），如多环芳烃、有机氯类等。但对其危害目前尚无人深入研究。 

    2.有机肥利用状况 

    我们有利用有机肥自农耕时代就开始了。早在3000多年前的春秋时期，我国的农民就开始应用有机肥。到了汉代，已有有机肥10多种，并开始应用种肥、基肥、追肥等不同的施肥技术。南宋陈敷的农书云：“若能时加新沃之土壤，以粪治之，则益精熟肥美，其力当常新壮矣”。这种地力常新的理论，指导着我国农民在几千年的农耕中，努力开拓有机肥来源，农民大量使用有机肥料，一方面保护了土壤肥力，做到了土地肥力长盛不衰，另一方面形成了无废物污染物排放的农业循环经济，保护了农村环境的安全。到了清代，据杨双山的“知本提纲”，我国已有有机肥10大类100多种。直到近代，因为引进化肥，有机肥才逐步让出了独占鳌头的地位。但在上个世纪50-60年代，有机肥仍占有主要地位。据农业部的数据，有机肥在肥料总投入量中的比例为：1949年99.9%，1957年91.0%，1965年80.7％，1975年66.4％，1980年47.1％，1985年43.7%，1990年37.4%。据李家康的研究，这一比例在1995年降至32.1%，2000年继续降至30.6%。再据《2004年中国环境状况公报》公布的数字，2003年全国有机肥施用量仅占肥料施用总量的25%。总之，我国施用有机肥的比例形势严峻不容乐观。 

    我国农业科技人员认为，有机肥以占50%左右的比例为适当比例，高产田可以低一些，化肥与有机肥的比例约为60：40，而低产田还应更高一些，化肥与有机肥的比例约为40：60。由此可见，目前有机肥的施用比例是很不恰当的。 

    从有机肥的基本资源量来看，畜禽粪便和秸秆是*主要的有机肥资源，其养分含量约占有机肥养分总量的90%，而且数量一直在迅速增长，其他种类的有机肥资源量或利用量则在下降，如绿肥、河湖淤泥、熏土、生活垃圾与污水、海肥等。这些有机肥料除绿肥在一些地方还起着重要作用外，其他的肥料已不再是有机肥的主要种类。所以，畜禽粪便与秸秆的有效利用是*主要的任务。